一種水溶性超順磁性群集奈米粒子之製造方法，包含下列步驟。將複數個超順磁性氧化鐵奈米粒子與水溶性維生素E，加入油性溶劑、去離子水或水溶液，形成乳化溶液，其中乳化溶液包括複數個小油滴，這些小油滴的超順磁性氧化鐵奈米粒子係呈分散排列且包覆於水溶性維生素E中。然後，再加熱去除乳化溶液的油性溶劑，以使這些小油滴形成複數個水溶性超順磁性群集奈米粒子，其中?一水溶性超順磁性群集奈米粒子的超順磁性氧化鐵奈米粒子係呈規則排列且包覆於水溶性維生素E中。